Histopathology data for Clasp1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #1 Thyroid
HET M #5 Thyroid
HET M #5 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #8 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #6 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #6 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #5 Eye [MA:0000261]
HET M #8 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #8 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #6 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #6 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #7 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET M #5 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #5 Trachea [MA:0000441]
HET M #8 Femur [MA:0001359]
HET M #6 Testis [MA:0000411]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #7 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #7 Small intestine [MA:0000337]
HET M #5 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET M #6 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #8 Tongue [MA:0000347]
HET M #8 Small intestine [MA:0000337]
HET F #7 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #6 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #7 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET F #7 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #6 Thymus [MA:0000142]
HET M #5 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #5 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #8 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #7 Spleen [MA:0000141]
HET M #6 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET F #7 Femur [MA:0001359]
HET M #6 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #6 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #8 Bone [MA:0001459]
HET M #6 Lymph node [MA:0000139]
HET M #5 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #8 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #7 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #8 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #8 Lung [MA:0000415]
HET M #8 Lymph node [MA:0000139]
HET M #6 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #5 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #7 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #8 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #5 Brain [MA:0000168]
HET M #5 Skin [MA:0000151]
HET F #7 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #6 Esophagus [MA:0000352]
HET M #6 Brown adipose tissue [MA:0000057] 1 0 Mild multifocal histiocytic steatitis
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #7 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET F #7 Large intestine [MA:0000333]
HET M #6 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #5 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #8 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET M #8 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #8 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #5 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #7 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #6 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #6 Ear [MA:0000236]
HET M #5 Heart [MA:0000072]
HET M #8 Testis [MA:0000411]
HET M #5 Lymph node [MA:0000139]
HET M #8 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #5 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET M #8 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #7 Kidney [MA:0000368]
HET M #8 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET M #5 Bone [MA:0001459]
HET F #7 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Thyroid
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #7 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #8 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Thyroid
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Thyroid
HET M #5 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET M #5 Esophagus [MA:0000352]
HET M #5 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #7 Ear [MA:0000236]
HET M #8 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #7 Ovary [MA:0000384]
HET M #6 Spleen [MA:0000141]
HET M #5 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #7 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #5 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET M #6 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #7 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET M #6 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Brain [MA:0000168] 1 0 Mild hydrocephalus
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #8 Liver [MA:0000358] 1 0 Mild diffuse periportal vacuolar degeneration (glycogen)
HET M #6 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET F #7 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 2 0 uterine cystic endometrial hyperplasia
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #6 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #7 Uterus [MA:0000389]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET M #5 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET M #6 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #7 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #7 Skin [MA:0000151]
HET M #5 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #8 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #6 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #8 Esophagus [MA:0000352]
HET M #8 Heart [MA:0000072]
HET F #7 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #8 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 2 0 uterine cystic endometrial hyperplasia
HET M #6 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #8 Thyroid
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET M #6 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #8 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET M #5 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET M #6 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET M #6 Trachea [MA:0000441]
HET M #8 Kidney [MA:0000368]
HET M #5 Large intestine [MA:0000333]
HET M #8 Thymus [MA:0000142]
HET M #5 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #8 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #6 Bone [MA:0001459]
HET M #8 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #6 Thyroid
HET M #8 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #6 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET M #8 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #7 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #5 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #6 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET F #7 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #7 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #6 Epididymis [MA:0000397] 1 0 Mild interstitial edema
HET M #6 Tibia [MA:0001361]
HET M #6 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #7 Eye [MA:0000261]
HET M #5 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET M #5 Pancreas [MA:0000120]
HET M #6 Skin [MA:0000151]
HET F #7 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #8 Sternum [MA:0001331]
HET M #5 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET M #6 Liver [MA:0000358]
HET M #5 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET M #6 Brain [MA:0000168]
HET M #5 Tooth [MA:0000348]
HET F #7 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #5 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #8 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #6 Stomach [MA:0000353]
HET F #7 Tongue [MA:0000347]
HET F #7 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #5 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #7 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET M #5 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #7 Trachea [MA:0000441]
HET F #7 Lymph node [MA:0000139]
HET M #5 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #8 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #8 Tooth [MA:0000348]
HET M #5 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #7 Thyroid
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #7 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #8 Epididymis [MA:0000397]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter