Histopathology data for Chrnd

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET M #2 Skin [MA:0000151] 1 0 mild regionally extensive dermatitis
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 1 0 mild cholecystitis
HET F #4 Thyroid
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Thyroid
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Thyroid
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Thyroid
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Kidney [MA:0000368] 1 0 mild pyelitis
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter