Histopathology data for Chordc1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Thyroid
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Thyroid
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Thyroid
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Tongue [MA:0000347] 1 0 mild focal glossitis
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Thyroid
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter