Histopathology data for Cep290

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Thyroid
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Thyroid
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET F #1 Thyroid
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Thyroid
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter