Histopathology data for Bicc1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Thyroid
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Thyroid
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Thyroid
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Thyroid
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter