International Mouse Phenotyping Resource of Standardised Screens
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Parameters for Procedure: Gross Pathology and Tissue Collection IMPC_PAT_002
Procedure carried out on Week 16
| Version | Type | Req. Upload | Req. Analysis | Annotation | Increment | Option | Ontology Options | Derived | Unit | Data Type | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Brain IMPC_PAT_001_002 | 2.0 | ontologyParameter |  |
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[PATO:0000122] length
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| Spinal cord IMPC_PAT_003_002 | 2.0 | ontologyParameter | |
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[PATO:0002406] friable
[PATO:0002376] air-filled
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[PATO:0000954] pink
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|
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[PATO:0000953] orange
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|
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| Liver IMPC_PAT_010_002 | 2.0 | ontologyParameter | |
|
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[PATO:0001334] diameter
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[PATO:0000411] round
[PATO:0001891] oval
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[PATO:0000330] irregular
[PATO:0001369] raised
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[PATO:0001199] linear
[PATO:0000387] soft
[PATO:0000386] hard
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[PATO:0000322] red
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[PATO:0002410] beige
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[PATO:0000366] left
[PATO:0000367] right
[PATO:0000324] yellow
[PATO:0000953] orange
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[PATO:0001566] diffuse
[PATO:0000634] unilateral
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[PATO:0000632] symmetrical
[PATO:0000122] length
[PATO:0002450] firm
|
TEXT | |||||
| Gall bladder IMPC_PAT_011_002 | 2.0 | ontologyParameter | |
|
[PATO:0001323] area
[PATO:0001334] diameter
[PATO:0000918] volume
[PATO:0000411] round
[PATO:0001891] oval
[PATO:0000407] flat
[PATO:0000330] irregular
[PATO:0001369] raised
[PATO:0002416] sunken
[PATO:0001199] linear
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[PATO:0000952] brown
[PATO:0000954] pink
[PATO:0000950] grey
[PATO:0000323] white
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| Nasal cavity IMPC_PAT_070_001 | 1.0 | ontologyParameter | + Expand [PATO:0001323] area
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| Ear IMPC_PAT_071_001 | 1.0 | ontologyParameter | [MP:0002102] abnormal ear morphology
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| Tooth IMPC_PAT_072_001 | 1.0 | ontologyParameter | + Expand [PATO:0001323] area
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| Tongue IMPC_PAT_073_001 | 1.0 | ontologyParameter | + Expand [PATO:0001323] area
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[PATO:0000330] irregular
[PATO:0001369] raised
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[PATO:0001199] linear
[PATO:0000387] soft
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[PATO:0002409] fluid-filled
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| Sciatic nerve IMPC_PAT_074_001 | 1.0 | ontologyParameter | + Expand [PATO:0001323] area
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[PATO:0000387] soft
[PATO:0000386] hard
[PATO:0002406] friable
[PATO:0002376] air-filled
[PATO:0002409] fluid-filled
[PATO:0002408] watery
[PATO:0000322] red
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[PATO:0002410] beige
[PATO:0000318] blue
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[PATO:0000417] absolute number value
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[PATO:0000367] right
[PATO:0000324] yellow
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TEXT | |||||||
| Bone IMPC_PAT_075_001 | 1.0 | ontologyParameter | [MP:0002169] normal
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