Histopathology data for Ubc

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Thyroid
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 1 0 acute unilateral spermatocoele
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Thyroid
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Thyroid
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Thyroid
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter