Histopathology data for Slc52a2

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #3 Thyroid 0 0
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 1 0 localized trilateral hydrocephalus
HET M #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #1 Eye [MA:0000261] 1 0 multifocal to coalescing cataracts
HET F #2 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Thyroid 0 0
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #2 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 1 1 0 0 localized localized Lymphoid hyperplasia with histiocytosis Lymphoid hyperplasia with histiocytosis
HET M #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #1 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0 0 0
HET M #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 1 1 0 0 0 0 localized localized Lymphoid hyperplasia with histiocytosis Lymphoid hyperplasia with histiocytosis
HET F #4 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #3 Brain [MA:0000168] 1 0 0 0 localized trilateral hydrocephalus
HET F #4 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #4 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #1 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 1 0 localized Lymphoid hyperplasia with histiocytosis
HET F #2 Liver [MA:0000358] 1 1 0 0 distributed subacute multi-localised Hepatocellular vacuolar change (midzonal and pericentral) Mononuclear inflammatory aggregates
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Brain [MA:0000168] 1 0 localized trilateral hydrocephalus
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #2 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #1 Thyroid 0 0
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #1 Liver [MA:0000358] 1 0 distributed Hepatocellular vacuolar change (midzonal and pericentral)
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 1 0 0 0 localized Epithelial cyst
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #1 Brain [MA:0000168] 1 0 localized trilateral hydrocephalus
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 1 0 0 distributed Hepatocellular vacuolar change (midzonal and pericentral)
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #1 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 1 0 localized Lymphoid hyperplasia with histiocytosis
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #4 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter