Histopathology data for Rpap3

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Thyroid
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET F #4 Thyroid
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Thyroid
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Thyroid
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 2 0 thymic lymphoma

Associated histopathology images

Rpap3
heterozygote
Thymus - MA term MA:0000142
Rpap3em1(IMPC)Mbp
experimental
Rpap3
heterozygote
Thymus - MA term MA:0000142
Rpap3em1(IMPC)Mbp
experimental

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter