banner
Genes Phenotypes Help, News, Blog

Histopathology data for Qars

Home Genes Qars Histopathology

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Thyroid
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Paracortical and follicular lymphoid hyperplasia, mild
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Testis [MA:0000411] 1 0 Testis, unilateral: Mild, multifocal, tubular degeneration, necrosis and atrophy
HET F #1 Eye [MA:0000261] 1 0 Eye, unilateral: Retinal dysplasia, multifocal, mild
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120] 1 0 Peri-pancreatic adipose tissue: Lymphocytic cellular infiltrates, multifocal, mild
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Thyroid
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Follicular lymphoid hyperplasia, mild
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Thyroid
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Paracortical and follicular lymphoid hyperplasia, mild
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 1 0 Spleen: Extramedullary hematopoiesis, mild increase
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Thyroid
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Spleen [MA:0000141] 1 0 Spleen: Extramedullary hematopoiesis, mild increase
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284] 2 0 Nasal cavity: Septal deviation, moderate
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Eye [MA:0000261] 1 0 Eye, unilateral: Retinal dysplasia, focal, minimal
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter