Histopathology data for Ptpmt1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Eye [MA:0000261] 1 0 localized Focal retinal fold (dysplasia)
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 1 0 focally extensive chronic Right ventricular epicardial fibrosis, focal
HET F #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #1 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #1 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #1 Heart [MA:0000072] 1 0 focally extensive chronic Right ventricular epicardial fibrosis, focal
HET M #1 Thyroid 0 0
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #2 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #1 Sternum [MA:0001331] Not applicable 0 Sternal segment dislocation
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #1 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 1 0 localized Dysplasia
HET M #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Thyroid 0 0
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #3 Sternum [MA:0001331] Not applicable 0 Sternal segment dislocation
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #1 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #4 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #4 Thyroid 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #1 Skin [MA:0000151] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter