Histopathology data for Pkdcc

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Thyroid
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Thyroid
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Thyroid
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Thyroid
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter