Histopathology data for Patl1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #2 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #2 Thyroid 0 0
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #4 Thyroid 0 0
HET F #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #1 Thyroid 0 0
HET F #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #4 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #3 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #3 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #3 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #2 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #3 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #2 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #1 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #4 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #3 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #3 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #2 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #1 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #3 Thyroid 0 0
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #2 Lung [MA:0000415] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter