Histopathology data for Nr6a1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #1 Heart [MA:0000072] 2 0 chronic localized Right ventricular fibrosis
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #2 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #2 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #4 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #4 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Thyroid 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #4 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #1 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #2 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #1 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #1 Thyroid 0 0
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Thyroid 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #4 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0

Associated histopathology images

Nr6a1
heterozygote
Nr6a1tm1b(EUCOMM)Wtsi
experimental

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter