Histopathology data for Fos

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Thyroid
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Thyroid
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET M #1 Thyroid
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Thyroid
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter