Histopathology data for Fadd

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] normal [MPATH:458]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #1 Ovary [MA:0000384] normal [MPATH:458]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397] normal [MPATH:458]
HET M #4 Prostate normal [MPATH:458]
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] normal [MPATH:458]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] normal [MPATH:458]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] normal [MPATH:458]
HET M #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #4 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] normal [MPATH:458]
HET M #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] normal [MPATH:458]
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] normal [MPATH:458]
HET M #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET M #4 Thymus [MA:0000142] normal [MPATH:458]
HET M #4 Eye with optic nerve Not applicable 0 Ectopic retinal nuclear cells
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Heart [MA:0000072] normal [MPATH:458]
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] normal [MPATH:458]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] normal [MPATH:458]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Stomach [MA:0000353] normal [MPATH:458]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148] normal [MPATH:458]
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] normal [MPATH:458]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #4 Thyroid normal [MPATH:458]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #4 Spleen [MA:0000141] normal [MPATH:458]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Testes 0 0
HET M #3 Eye with optic nerve 0 0
HET M #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #1 Kidney [MA:0000368] normal [MPATH:458]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] normal [MPATH:458]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] normal [MPATH:458]
HET M #4 Skin [MA:0000151] normal [MPATH:458]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] normal [MPATH:458]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337] normal [MPATH:458]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #2 Lung [MA:0000415] normal [MPATH:458]
HET M #4 Prostate 0 0
HET F #1 Lung [MA:0000415] normal [MPATH:458]
HET M #4 Eye with optic nerve developmental dysplasia [MPATH:64] multifocal to coalescing
HET F #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] normal [MPATH:458]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] normal [MPATH:458]
HET F #1 Spleen [MA:0000141] normal [MPATH:458]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] normal [MPATH:458]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Lung [MA:0000415] normal [MPATH:458]
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Uterus [MA:0000389] normal [MPATH:458]
HET M #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Thyroid normal [MPATH:458]
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] normal [MPATH:458]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Liver [MA:0000358] normal [MPATH:458]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] normal [MPATH:458]
HET M #4 Stomach [MA:0000353] normal [MPATH:458]
HET M #3 Thyroid 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] normal [MPATH:458]
HET M #3 Skin [MA:0000151] normal [MPATH:458]
HET M #3 Eye with optic nerve normal [MPATH:458]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] normal [MPATH:458]
HET F #1 Eye with optic nerve normal [MPATH:458]
HET M #4 Lung [MA:0000415] normal [MPATH:458]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] normal [MPATH:458]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] normal [MPATH:458]
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] normal [MPATH:458]
HET M #4 Liver [MA:0000358] normal [MPATH:458]
HET F #1 Skin [MA:0000151] normal [MPATH:458]
HET F #2 Kidney [MA:0000368] normal [MPATH:458]
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] normal [MPATH:458]
HET M #4 Testes normal [MPATH:458]
HET M #3 Thymus [MA:0000142] normal [MPATH:458]
HET F #2 Ovary [MA:0000384] normal [MPATH:458]
HET F #1 Thyroid 0 0
HET M #4 Brain [MA:0000168] normal [MPATH:458]
HET F #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] normal [MPATH:458]
HET M #4 Thyroid 0 0
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #3 Prostate normal [MPATH:458]
HET F #1 Thyroid normal [MPATH:458]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] normal [MPATH:458]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #4 Pancreas [MA:0000120] normal [MPATH:458]
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] normal [MPATH:458]
HET M #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] normal [MPATH:458]
HET F #2 Eye with optic nerve 0 0
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] normal [MPATH:458]
HET M #4 Kidney [MA:0000368] normal [MPATH:458]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #1 Thymus [MA:0000142] normal [MPATH:458]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] normal [MPATH:458]
HET M #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] normal [MPATH:458]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] normal [MPATH:458]
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] normal [MPATH:458]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116] normal [MPATH:458]
HET F #2 Skin [MA:0000151] normal [MPATH:458]
HET F #2 Brain [MA:0000168] normal [MPATH:458]
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] normal [MPATH:458]
HET F #2 Eye with optic nerve normal [MPATH:458]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] normal [MPATH:458]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352] normal [MPATH:458]
HET M #4 Heart [MA:0000072] normal [MPATH:458]
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] normal [MPATH:458]
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] normal [MPATH:458]
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Testes 0 0
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] normal [MPATH:458]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #4 Large intestine [MA:0000333] normal [MPATH:458]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] normal [MPATH:458]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Prostate 0 0
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380] normal [MPATH:458]
HET M #3 Trachea [MA:0000441] normal [MPATH:458]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] normal [MPATH:458]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] normal [MPATH:458]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] normal [MPATH:458]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Eye with optic nerve 0 0
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] normal [MPATH:458]
HET F #1 Uterus [MA:0000389] normal [MPATH:458]
HET M #3 Brain [MA:0000168] normal [MPATH:458]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #4 Trachea [MA:0000441] normal [MPATH:458]
HET F #2 Thymus [MA:0000142] normal [MPATH:458]
HET M #3 Testes normal [MPATH:458]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216] normal [MPATH:458]
HET F #2 Thyroid normal [MPATH:458]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410] normal [MPATH:458]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] normal [MPATH:458]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] normal [MPATH:458]
HET F #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] normal [MPATH:458]
HET M #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #1 Trachea [MA:0000441] normal [MPATH:458]
HET M #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] normal [MPATH:458]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter