Histopathology data for Clcf1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 1 0 localized acute Mild acute gasrtuitis
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #1 Thyroid 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Heart [MA:0000072] 0 3 0 0 chronic localized Right ventricular epicardial fibrosis
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #1 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #4 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #1 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #4 Thyroid 0 0
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #2 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Thyroid 0 0
HET M #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #1 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #1 Sternum [MA:0001331] 3 0 localized chronic sternal segment dislocation
HET M #1 Stomach [MA:0000353] 1 0 localized acute focal mild acute gastritis
HET M #1 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #2 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #4 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #4 Testis [MA:0000411] Not applicable

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter