Histopathology data for Champ1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Thyroid
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 1 0 hydrometra
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Thyroid
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Thyroid
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #2 Skin [MA:0000151]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter