Histopathology data for Ahcy

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #1 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #2 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #1 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #4 Sternum [MA:0001331] 3 0 chronic localized Sternal segment dislocation
HET M #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #4 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #4 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #4 Heart [MA:0000072] 2 0 chronic localized Right ventricular epicardial fibrosis, focal
HET M #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #2 Thyroid 0 0
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #3 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #1 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #3 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #1 Lung [MA:0000415] 1 0 multi-localised chronic Peribronchiolar inflammatory aggregates.
HET F #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #3 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #4 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #2 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #2 Lung [MA:0000415] 1 0 chronic multi-localised Perivascular inflammatory aggregates.
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #4 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #3 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #2 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #2 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #3 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #4 Thyroid 0 0
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #3 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #4 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #3 Thyroid 0 0
HET M #2 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #1 Thyroid 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter