Histopathology data for Ache

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Thyroid
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #4 Thyroid
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Thyroid
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Thyroid
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter