Histopathology data for 1700003F12Rik

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #3 Spleen [MA:0000141] normal [MPATH:458]
HET F #3 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #2 Stomach [MA:0000353] normal [MPATH:458]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #3 Kidney [MA:0000368] normal [MPATH:458]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] normal [MPATH:458]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352] normal [MPATH:458]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120] normal [MPATH:458]
HET F #3 Skin [MA:0000151] normal [MPATH:458]
HET F #4 Kidney [MA:0000368] normal [MPATH:458]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139] normal [MPATH:458]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #3 Liver [MA:0000358] normal [MPATH:458]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Brain [MA:0000168] normal [MPATH:458]
HET M #2 Thymus [MA:0000142] normal [MPATH:458]
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] normal [MPATH:458]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134] normal [MPATH:458]
HET M #1 Eye with optic nerve developmental dysplasia [MPATH:64] localized
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] normal [MPATH:458]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] normal [MPATH:458]
HET F #4 Liver [MA:0000358] normal [MPATH:458]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352] normal [MPATH:458]
HET M #1 Kidney [MA:0000368] normal [MPATH:458]
HET M #1 Spleen [MA:0000141] normal [MPATH:458]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #2 Testes normal [MPATH:458]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #1 Skin [MA:0000151] normal [MPATH:458]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] normal [MPATH:458]
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116] normal [MPATH:458]
HET M #2 Sternum [MA:0001331] Not applicable 0 Sternal dislocation with reparative chondroid hyperplasia ('calus')
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284] normal [MPATH:458]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] normal [MPATH:458]
HET F #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Thyroid 0 0
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216] normal [MPATH:458]
HET M #1 Lung [MA:0000415] normal [MPATH:458]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] normal [MPATH:458]
HET M #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #1 Liver [MA:0000358] normal [MPATH:458]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] normal [MPATH:458]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410] normal [MPATH:458]
HET M #1 Testes normal [MPATH:458]
HET M #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #2 Lung [MA:0000415] normal [MPATH:458]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #2 Brain [MA:0000168] normal [MPATH:458]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #2 Femur [MA:0001359] normal [MPATH:458]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116] normal [MPATH:458]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216] normal [MPATH:458]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #3 Brain [MA:0000168] normal [MPATH:458]
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Thyroid normal [MPATH:458]
HET M #2 Prostate 0 0
HET M #2 Epididymis [MA:0000397] normal [MPATH:458]
HET M #2 Eye with optic nerve 0 0
HET F #3 Uterus [MA:0000389] normal [MPATH:458]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] normal [MPATH:458]
HET F #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #3 Thyroid 0 0
HET F #4 Stomach [MA:0000353] normal [MPATH:458]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] normal [MPATH:458]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #2 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #2 Testes 0 0
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #4 Eye with optic nerve normal [MPATH:458]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380] normal [MPATH:458]
HET M #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #2 Sternum [MA:0001331] process of degenerative change [MPATH:14] focally extensive chronic
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356] normal [MPATH:458]
HET F #4 Trachea [MA:0000441] normal [MPATH:458]
HET M #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] normal [MPATH:458]
HET F #3 Lung [MA:0000415] normal [MPATH:458]
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] normal [MPATH:458]
HET F #4 Skin [MA:0000151] normal [MPATH:458]
HET M #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #3 Heart [MA:0000072] normal [MPATH:458]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346] normal [MPATH:458]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380] normal [MPATH:458]
HET F #4 Ovary [MA:0000384] normal [MPATH:458]
HET F #3 Eye with optic nerve 0 0
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #3 Thymus [MA:0000142] normal [MPATH:458]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #2 Liver [MA:0000358] normal [MPATH:458]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] normal [MPATH:458]
HET F #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] normal [MPATH:458]
HET M #2 Trachea [MA:0000441] normal [MPATH:458]
HET M #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #3 Stomach [MA:0000353] normal [MPATH:458]
HET M #2 Thyroid 0 0
HET M #2 Heart [MA:0000072] 1 0 Right ventricular epicardial fibrosis, focal
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #3 Large intestine [MA:0000333] normal [MPATH:458]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #2 Pancreas [MA:0000120] normal [MPATH:458]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] normal [MPATH:458]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] normal [MPATH:458]
HET M #1 Thymus [MA:0000142] normal [MPATH:458]
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #1 Heart [MA:0000072] fibrosis [MPATH:181] normal [MPATH:458] focally extensive
HET M #1 Large intestine [MA:0000333] normal [MPATH:458]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] normal [MPATH:458]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #2 Spleen [MA:0000141] normal [MPATH:458]
HET F #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #2 Kidney [MA:0000368] normal [MPATH:458]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145] normal [MPATH:458]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356] normal [MPATH:458]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148] normal [MPATH:458]
HET F #4 Thymus [MA:0000142] normal [MPATH:458]
HET M #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Prostate 0 0
HET M #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #2 Heart [MA:0000072] fibrosis [MPATH:181] focally extensive chronic
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Thyroid 0 0
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #2 Skin [MA:0000151] normal [MPATH:458]
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 Testes 0 0
HET M #2 Small intestine [MA:0000337] normal [MPATH:458]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #3 Thyroid normal [MPATH:458]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #1 Small intestine [MA:0000337] normal [MPATH:458]
HET M #2 Tongue [MA:0000347] normal [MPATH:458]
HET M #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #1 Trachea [MA:0000441] normal [MPATH:458]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380] normal [MPATH:458]
HET F #4 Lung [MA:0000415] normal [MPATH:458]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148] normal [MPATH:458]
HET M #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #4 Heart [MA:0000072] normal [MPATH:458]
HET M #1 Heart [MA:0000072] 1 0 Right ventricular epicardial fibrosis, focal
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #3 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2
HET M #2 Eye with optic nerve normal [MPATH:458]
HET M #2 Thyroid normal [MPATH:458]
HET M #2 Ear [MA:0000236] normal [MPATH:458]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172] normal [MPATH:458]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #3 Eye with optic nerve normal [MPATH:458]
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #2 Prostate normal [MPATH:458]
HET M #1 Thyroid normal [MPATH:458]
HET F #4 Brain [MA:0000168] normal [MPATH:458]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337] normal [MPATH:458]
HET M #2 Tooth [MA:0000348] normal [MPATH:458]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333] normal [MPATH:458]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Esophagus [MA:0000352] normal [MPATH:458]
HET M #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #4 Uterus [MA:0000389] normal [MPATH:458]
HET F #4 Eye with optic nerve 0 0
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #3 Ovary [MA:0000384] normal [MPATH:458]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Spleen [MA:0000141] normal [MPATH:458]
HET M #1 Prostate normal [MPATH:458]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148] normal [MPATH:458]
HET M #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #1 Stomach [MA:0000353] normal [MPATH:458]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216] normal [MPATH:458]
HET F #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #3 Trachea [MA:0000441] normal [MPATH:458]
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] normal [MPATH:458]
HET F #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #1 Eye with optic nerve 1 0 Retinal dysplasia and persistent hyaloid srtery remnant

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter