This page introduces cardiovascular related phenotypes present in mouse lines produced by the IMPC. The cardiovascular system refers to the observable morphological and physiological characteristics of the mammalian heart, blood vessels, or circulatory system that are manifested through development and lifespan.
Approach
In order to identify the function of genes, the consortium uses a series of standardised protocols as described in IMPReSS (International Mouse Phenotyping Resource of Standardised Screens).
Heart and vascular function/physiology are measured through several procedures like echocardiography and electrocardiogram and non-invasive blood pressure. Cardiovascular system morphology is assessed through macroscopic and microscopic measurements, like heart weight, gross pathology and gross morphology in both embryo and adult animals. A complete list of protocols and related phenotypes are presented in the table below. Links to impress are provided for more details on the procedure.
Procedures that can lead to relevant phenotype associations
Young Adult:
- Echo HMGULA v1 , HRWLLA v1 , HMGULA v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , NINGLA v1 , BCMLA v1 , IMPC v1 , ICSLA v1
- Electrocardiogram (ECG) TCPLA v2 , BCMLA v2 , JAXLA v1 , IMPC v1 , IMPC v2 , IMPC v2 , IMPC v2 , JAXLA v3 , UCDLA v2 , IMPC v1 , UCDLA v3 , HRWLLA v2 , IMPC v3 , ICSLA v2 , IMPC v3 , IMPC v3 , IMPC v2 , IMPC v2 , IMPC v1 , TCPLA v3 , HRWLLA v1 , RBRCLA v3 , IMPC v2 , IMPC v3 , KMPCLA v2 , RBRCLA v1 , HMGULA v1 , BCMLA v3 , IMPC v1 , IMPC v3 , IMPC v2 , IMPC v3 , HMGULA v3 , IMPC v1 , IMPC v2 , HMGULA v1 , HRWLLA v3 , IMPC v1 , IMPC v2 , ICSLA v3 , IMPC v3 , IMPC v3 , IMPC v3 , HMGULA v3 , IMPC v1 , KMPCLA v3 , IMPC v1 , JAXLA v2
- Eye Morphology BCMLA v3 , IMPC v1 , IMPC v1 , JAXLA v2 , TCPLA v2 , JAXLA v3 , IMPC v2 , IMPC v2 , HRWLLA v2 , IMPC v1 , IMPC v3 , KMPCLA v1 , HRWLLA v3 , IMPC v3 , TCPLA v3 , UCDLA v2 , IMPC v3 , IMPC v3 , IMPC v2 , KMPCLA v3 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v2 , IMPC v3 , HAS v2 , IMPC v3 , NINGLA v1 , IMPC v1 , ICSLA v3 , IMPC v3 , IMPC v2 , IMPC v2 , IMPC v3 , HRWLLA v1 , IMPC v1 , ICSLA v2 , IMPC v2 , IMPC v2 , IMPC v3 , IMPC v1 , BCMLA v1 , IMPC v2 , IMPC v3 , JAXLA v1 , UCDLA v3 , RBRCLA v1 , IMPC v2 , IMPC v1
- Heart Dissection M-G-P v1
- Heart Weight IMPC v1 , IMPC v1 , RBRCLA v1 , NINGLA v1 , IMPC v1 , ICSLA v1 , JAXLA v1 , HMGULA v1 , KMPCLA v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , HMGULA v1 , IMPC v1 , BCMLA v1 , IMPC v1 , TCPLA v1 , UCDLA v1 , IMPC v1
- Heart weight/tibia length ESLIM v1
- Indirect ophthalmoscopy HAS v1 , ESLIM v1
- Non-Invasive blood pressure ESLIM v1
- Ophthalmoscope M-G-P v1
- Organ Weight HRWL v1 , UCD v1 , HRWLLA v1
- Slit Lamp HAS v1 , ESLIM v1 , HAROLD v1 , M-G-P v1
Embryo:
- Gross Morphology Embryo E12.5 IMPC v1 , IMPC v3 , IMPC v3 , IMPC v1 , IMPC v3 , IMPC v2 , IMPC v2 , IMPC v3 , IMPC v3 , IMPC v3 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v3 , IMPC v2 , IMPC v2 , IMPC v2 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v3 , IMPC v2
- Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5 IMPC v3 , IMPC v2 , IMPC v3 , IMPC v1 , IMPC v2 , IMPC v1 , IMPC v3 , IMPC v1 , IMPC v2 , IMPC v3 , IMPC v1 , IMPC v3 , IMPC v2 , IMPC v1 , IMPC v3 , IMPC v2 , IMPC v3 , IMPC v2 , IMPC v1 , IMPC v3
- Gross Morphology Embryo E18.5 IMPC v2 , IMPC v2 , IMPC v3 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v2 , IMPC v1 , IMPC v3 , IMPC v2 , IMPC v1 , IMPC v3 , IMPC v3 , IMPC v3 , IMPC v3 , IMPC v3 , IMPC v3 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v2 , IMPC v2
- Gross Morphology Embryo E9.5 IMPC v1 , IMPC v3 , IMPC v3 , IMPC v1 , IMPC v3 , IMPC v2 , IMPC v1 , IMPC v3 , IMPC v3 , IMPC v1 , IMPC v3 , IMPC v1 , IMPC v2 , IMPC v2 , IMPC v2 , IMPC v2 , IMPC v3 , IMPC v3 , IMPC v1 , IMPC v2
- Gross Morphology Placenta E12.5 IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1
- Gross Morphology Placenta E14.5-E15.5 IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1
- Gross Morphology Placenta E18.5 IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1
- Gross Morphology Placenta E9.5 IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1 , IMPC v1
Phenotypes distribution
This graph shows genes with a significant effect on at least one cardiovascular system phenotype.
The following diagram represents the various biological system phenotypes associations for genes linked to cardiovascular system phenotypes. The line thickness is correlated with the strength of the association.
Clicking on chosen phenotype(s) on the diagram allow to select common genes. Corresponding gene lists can be downloaded using the download icon.