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Phenotype: abnormal eye anterior chamber depth

Definition
anomaly in the distance between the iris and the cornea at the center plane (maximum distance) of the eye anterior chamber compared to controls
Synonyms
abnormal ACD
Significant gene associations The way we measure Phenotype stats
0%
of tested genes
0
significant genes
0
tested genes

IMPC Gene variants with abnormal eye anterior chamber depth

Total number of significant genotype-phenotype associations: 66

Gene / Allele Zygosity Sex Life Stage Phenotype Parameter Phenotyping
Center		 P Value
Ccdc180
Ccdc180tm1b(KOMP)Wtsi 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 0.00
Smarcb1
Smarcb1tm1b(EUCOMM)Hmgu 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 2.72×10-33
Rpl7l1
Rpl7l1tm2b(EUCOMM)Hmgu 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 1.26×10-25
Podn
Podntm1b(KOMP)Wtsi 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 3.33×10-16
Sptlc1
Sptlc1em1(IMPC)Bay 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 8.91×10-11
Rd3
Rd3em1(IMPC)Bay 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 1.69×10-10
Gpr108
Gpr108tm1b(EUCOMM)Hmgu 		HOM   Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 ICS
IMPC		 6.03×10-10
Rspo1
Rspo1tm2b(KOMP)Wtsi 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 ICS
IMPC		 2.00×10-09
Sbk1
Sbk1tm1b(EUCOMM)Wtsi 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 5.66×10-09
Gpr101
Gpr101tm1b(KOMP)Mbp 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 ICS
IMPC		 7.55×10-09
Wbp1l
Wbp1ltm2b(EUCOMM)Hmgu 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 1.09×10-08
Pigq
Pigqtm2b(EUCOMM)Wtsi 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 1.28×10-08
Kank1
Kank1em1(IMPC)Bay 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 1.39×10-08
Cstb
Cstbtm1b(EUCOMM)Wtsi 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 ICS
IMPC		 1.44×10-08
Prdm14
Prdm14em1(IMPC)Bay 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 2.03×10-08
Dact2
Dact2tm1b(EUCOMM)Wtsi 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 2.28×10-08
Tmprss5
Tmprss5em1(IMPC)Bay 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 2.34×10-08
Lrrfip1
Lrrfip1tm1.1(KOMP)Wtsi 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 2.69×10-08
Plekhg3
Plekhg3tm1b(EUCOMM)Hmgu 		HOM   Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 ICS
IMPC		 3.08×10-08
Nos2
Nos2em1(IMPC)Bay 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 4.21×10-08
Slc37a1
Slc37a1tm1b(EUCOMM)Hmgu 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 ICS
IMPC		 7.96×10-08
Cbarp
Cbarptm2e.1(EUCOMM)Hmgu 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 8.74×10-08
Abhd15
Abhd15tm1b(KOMP)Wtsi 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 9.72×10-08
Csf2rb
Csf2rbtm2b(EUCOMM)Hmgu 		HET   Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 ICS
IMPC		 1.08×10-07
Pex14
Pex14em1(IMPC)Bay 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 1.14×10-07
Erc1
Erc1tm1b(EUCOMM)Hmgu 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 1.39×10-07
Dhx40
Dhx40tm1b(KOMP)Wtsi 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 4.82×10-07
Arhgap24
Arhgap24tm1b(KOMP)Wtsi 		HOM   Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 ICS
IMPC		 4.95×10-07
Sbk1
Sbk1tm1b(EUCOMM)Wtsi 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 5.06×10-07
4931406C07Rik
4931406C07Riktm1b(EUCOMM)Wtsi 		HOM   Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 5.33×10-07
Tm2d2
Tm2d2em1(IMPC)Bay 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 6.01×10-07
Dbn1
Dbn1em1(IMPC)Bay 		HOM   Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 6.41×10-07
Rundc3b
Rundc3bem1(IMPC)Bay 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 8.08×10-07
Adgrg7
Adgrg7tm1b(EUCOMM)Hmgu 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 1.26×10-06
Nlrp2
Nlrp2tm1b(KOMP)Wtsi 		HOM   Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 1.27×10-06
Ppara
Pparatm1b(EUCOMM)Wtsi 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 1.66×10-06
Hibadh
Hibadhtm1b(EUCOMM)Wtsi 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 2.03×10-06
Pde4dip
Pde4diptm1b(KOMP)Wtsi 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 2.18×10-06
Fzd8
Fzd8em1(IMPC)Bay 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 2.30×10-06
Cep295
Cep295em1(IMPC)Bay 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 5.15×10-06
Ube3b
Ube3bem1(IMPC)Bay 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 5.21×10-06
Vars2
Vars2em1(IMPC)Bay 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 7.65×10-06
Rad9a
Rad9atm1.1(KOMP)Wtsi 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 8.44×10-06
Slc35d1
Slc35d1tm2b(EUCOMM)Hmgu 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 8.54×10-06
Phf8
Phf8tm1dIcs 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 ICS
IMPC		 9.23×10-06
Fastkd2
Fastkd2tm1b(EUCOMM)Wtsi 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 9.84×10-06
Slc44a1
Slc44a1tm1b(EUCOMM)Hmgu 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 1.07×10-05
Ambra1
Ambra1em1(IMPC)Bay 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 1.10×10-05
Rasal3
Rasal3tm1b(EUCOMM)Hmgu 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 ICS
IMPC		 1.28×10-05
Vps9d1
Vps9d1tm1b(KOMP)Wtsi 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 1.41×10-05
Zfp930
Zfp930tm1b(KOMP)Wtsi 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 1.48×10-05
Phf8
Phf8tm1dIcs 		HEM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 ICS
IMPC		 2.53×10-05
Tatdn2
Tatdn2tm1b(EUCOMM)Hmgu 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 2.82×10-05
Trpm6
Trpm6tm1b(KOMP)Wtsi 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 ICS
IMPC		 2.89×10-05
Bmp4
Bmp4tm1b(EUCOMM)Hmgu 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 3.28×10-05
Tead1
Tead1tm1b(KOMP)Wtsi 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 4.22×10-05
Nr1d1
Nr1d1tm1(KOMP)Vlcg 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 4.48×10-05
Gp6
Gp6tm2b(EUCOMM)Hmgu 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 ICS
IMPC		 5.11×10-05
Arhgef40
Arhgef40em1(IMPC)Bay 		HOM   Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 5.24×10-05
Hadhb
Hadhbem1(IMPC)Bay 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Left anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 7.20×10-05
Il18rap
Il18raptm1b(KOMP)Wtsi 		HOM Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 ICS
IMPC		 7.36×10-05
Ecrg4
Ecrg4tm1b(EUCOMM)Hmgu 		HOM   Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 ICS
IMPC		 8.06×10-05
Snrnp40
Snrnp40em1(IMPC)Bay 		HET Early adult abnormal eye anterior chamber depth Right anterior chamber depth
Eye Morphology		 BCM
IMPC		 9.76×10-05

Download data as:   TSV   XLS

 The way we measure

Procedure
Eye Morphology

 Phenotype associations stats

7.84% of tested genes with null mutations on a B6N genetic background have a phenotype association to abnormal eye anterior chamber depth (61/778)

6.55% females (54/824) 0.25% males (2/811)

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