Phenotype: abnormal head size

Definition
anomaly in the average size of the portion of the body containing the brain and organs of sight, hearing, taste, and smell
0%
of tested genes
0
significant genes
0
tested genes

IMPC Gene variants with abnormal head size

Total number of significant genotype-phenotype associations: 148

Gene / Allele Zygosity Sex Life Stage Phenotype Parameter Phenotyping
Center
P Value
Actg1
Actg1tm1.1(KOMP)Vlcg
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Actg1
Actg1tm1.1(KOMP)Vlcg
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Amt
Amtem1(IMPC)Tcp
HOM E15.5 abnormal head size Head size
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
TCP
IMPC
0.00
Apbb2
Apbb2tm1.1(KOMP)Vlcg
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Apbb2
Apbb2tm1.1(KOMP)Vlcg
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Atp13a1
Atp13a1em1(IMPC)Tcp
HET E15.5 abnormal head size Head size
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
TCP
IMPC
0.00
Atp13a1
Atp13a1em1(IMPC)Tcp
HOM E15.5 abnormal head size Head size
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
TCP
IMPC
0.00
Cep97
Cep97tm1.1(KOMP)Vlcg
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Cep97
Cep97tm1.1(KOMP)Vlcg
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Cnnm2
Cnnm2tm1.1(KOMP)Vlcg
HOM E15.5 abnormal head size Head size
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Cnnm2
Cnnm2tm1.1(KOMP)Vlcg
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Cnnm2
Cnnm2tm1.1(KOMP)Vlcg
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Cwc22
Cwc22em1(IMPC)Mbp
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Dbn1
Dbn1tm1b(KOMP)Wtsi
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Dbn1
Dbn1tm1b(KOMP)Wtsi
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Dlg5
Dlg5tm1b(EUCOMM)Wtsi
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Dlg5
Dlg5tm1b(EUCOMM)Wtsi
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Dnm1
Dnm1tm1.1(KOMP)Vlcg
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Dnm1
Dnm1tm1.1(KOMP)Vlcg
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Enkur
Enkurem1(IMPC)Mbp
HOM E18.5 abnormal head size Head size
Gross Morphology Embryo E18.5
UC Davis
IMPC
0.00
Gabpa
Gabpaem2(IMPC)Mbp
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Gabpa
Gabpaem2(IMPC)Mbp
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Gjb3
Gjb3tm1.1(KOMP)Vlcg
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Gjb3
Gjb3tm1.1(KOMP)Vlcg
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Krt14
Krt14tm1.1(KOMP)Vlcg
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Krt14
Krt14tm1.1(KOMP)Vlcg
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Lgi4
Lgi4tm1.1(KOMP)Vlcg
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Lgi4
Lgi4tm1.1(KOMP)Vlcg
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Mbd6
Mbd6tm1.1(KOMP)Vlcg
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Mbd6
Mbd6tm1.1(KOMP)Vlcg
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Myb
Mybtm1b(KOMP)Wtsi
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Myb
Mybtm1b(KOMP)Wtsi
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Nalcn
Nalcnem1(IMPC)Mbp
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Nalcn
Nalcnem1(IMPC)Mbp
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Nxn
Nxnem1(IMPC)Bay
HOM E18.5 abnormal head size Head size
Gross Morphology Embryo E18.5
BCM
IMPC
0.00
Nxn
Nxntm1b(EUCOMM)Wtsi
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Nxn
Nxntm1b(EUCOMM)Wtsi
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Nxn
Nxntm1b(EUCOMM)Wtsi
HOM E18.5 abnormal head size Head size
Gross Morphology Embryo E18.5
BCM
IMPC
0.00
Pccb
Pccbtm1.1(KOMP)Vlcg
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Pccb
Pccbtm1.1(KOMP)Vlcg
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Phgdh
Phgdhtm1b(KOMP)Wtsi
HOM E15.5 abnormal head size Head size
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
KMPC
IMPC
0.00
Rbbp4
Rbbp4em1(IMPC)Mbp
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Rbm22
Rbm22em1(IMPC)Mbp
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Rnf10
Rnf10tm1b(KOMP)Wtsi
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Rnf10
Rnf10tm1b(KOMP)Wtsi
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Scx
Scxtm1.1(KOMP)Vlcg
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Scx
Scxtm1.1(KOMP)Vlcg
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Slc25a1
Slc25a1tm1b(EUCOMM)Wtsi
HOM E18.5 abnormal head size Head size
Gross Morphology Embryo E18.5
BCM
IMPC
0.00
Slmap
Slmapem1(IMPC)J
HOM E18.5 abnormal head size Head size
Gross Morphology Embryo E18.5
JAX
IMPC
0.00
Smg5
Smg5em1(IMPC)Mbp
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Snai2
Snai2tm1.1(KOMP)Vlcg
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Sptan1
Sptan1em1(IMPC)Mbp
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Tbr1
Tbr1tm1.1(KOMP)Mbp
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Tbr1
Tbr1tm1.1(KOMP)Mbp
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Tctn1
Tctn1em1(IMPC)Mbp
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Tctn1
Tctn1em1(IMPC)Mbp
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Tmem209
Tmem209em1(IMPC)Tcp
HOM E18.5 abnormal head size Head size
Gross Morphology Embryo E18.5
TCP
IMPC
0.00
Ubn2
Ubn2em1(IMPC)Tcp
HOM E18.5 abnormal head size Head size
Gross Morphology Embryo E18.5
TCP
IMPC
0.00
Ubr2
Ubr2tm1e.1(KOMP)Mbp
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Ubr2
Ubr2tm1e.1(KOMP)Mbp
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Ufsp2
Ufsp2em1(IMPC)Mbp
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Xpo1
Xpo1em1(IMPC)Mbp
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Xpo5
Xpo5em1(IMPC)Mbp
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Zc3h11a
Zc3h11aem1(IMPC)Mbp
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Zc3h4
Zc3h4em1(IMPC)Mbp
HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Zfp414
Zfp414em1(IMPC)Bay
HOM E18.5 abnormal head size Head size
Gross Morphology Embryo E18.5
BCM
IMPC
0.00
Zfp414
Zfp414em1(IMPC)Bay
HOM E18.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E18.5
BCM
IMPC
0.00
Zfp503
Zfp503em1(IMPC)Mbp
HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
UC Davis
IMPC
0.00
Spred1
Spred1em1(IMPC)Ccpcz
HOM Early adult abnormal head size Head size
Combined SHIRPA and Dysmorphology
CCP-IMG
IMPC
1.39×10-21
Mettl23
Mettl23em1(IMPC)Hmgu
HOM Early adult abnormal head size Head size
Combined SHIRPA and Dysmorphology
HMGU
IMPC
5.50×10-10
Cyb561
Cyb561tm1b(EUCOMM)Wtsi
HOM Early adult abnormal head size Head size
Combined SHIRPA and Dysmorphology
MRC Harwell
IMPC
9.65×10-10
Npr2
Npr2em1(IMPC)H
HOM Early adult abnormal head size Head size
Combined SHIRPA and Dysmorphology
MRC Harwell
IMPC
3.87×10-08
Smoc1
Smoc1tm1b(EUCOMM)Wtsi
HOM Early adult abnormal head size Head size
Combined SHIRPA and Dysmorphology
MRC Harwell
IMPC
3.87×10-08
Niban1
Niban1em1(IMPC)Ccpcz
HOM Early adult abnormal head size Head size
Combined SHIRPA and Dysmorphology
CCP-IMG
IMPC
3.03×10-06
Cdh11
Cdh11em1(IMPC)Mbp
HOM Early adult abnormal head size Head size
Combined SHIRPA and Dysmorphology
UC Davis
IMPC
4.01×10-05
Itch
Itchtm1b(EUCOMM)Hmgu
HOM Early adult abnormal head size Head size
Combined SHIRPA and Dysmorphology
MRC Harwell
IMPC
5.43×10-05
Ankrd44
Ankrd44em1(IMPC)J
HOM Early adult abnormal head size Head size
Combined SHIRPA and Dysmorphology
JAX
IMPC
9.84×10-05

Download data as:   TSV   XLS

 The way we measure

 Phenotype associations stats

1.11% of tested genes with null mutations on a B6N genetic background have a phenotype association to abnormal head size (51/4613)

0.99% females (45/4532) 1.08% males (49/4525)

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter