banner
Genes Phenotypes Help, News, Blog

Phenotype: spina bifida

Definition
common congenital midline defect of fusion of the vertebral arch
Synonyms
spinal dysraphism
Significant gene associations The way we measure Phenotype stats
0%
of tested genes
0
significant genes
0
tested genes

IMPC Gene variants with spina bifida

Total number of significant genotype-phenotype associations: 90

Gene / Allele Zygosity Sex Life Stage Phenotype Parameter Phenotyping
Center		 P Value
Actg1
Actg1tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Actg1
Actg1tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Ambra1
Ambra1em1(IMPC)Bay 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 BCM
IMPC		 0.00
Amt
Amtem1(IMPC)Tcp 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 TCP
IMPC		 0.00
Apbb2
Apbb2tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Apbb2
Apbb2tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Cep97
Cep97tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Cep97
Cep97tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Cnnm2
Cnnm2tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Cnnm2
Cnnm2tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Cwc22
Cwc22em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Dlg5
Dlg5tm1b(EUCOMM)Wtsi 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Dlg5
Dlg5tm1b(EUCOMM)Wtsi 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Dnm1
Dnm1tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Dnm1
Dnm1tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Gabpa
Gabpaem2(IMPC)Mbp 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Gabpa
Gabpaem2(IMPC)Mbp 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Krt14
Krt14tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Krt14
Krt14tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Mbd6
Mbd6tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Mbd6
Mbd6tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Myb
Mybtm1b(KOMP)Wtsi 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Myb
Mybtm1b(KOMP)Wtsi 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Nalcn
Nalcnem1(IMPC)Mbp 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Nalcn
Nalcnem1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Pccb
Pccbtm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Pccb
Pccbtm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Rbbp4
Rbbp4em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Rbm22
Rbm22em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Shroom3
Shroom3em1(IMPC)Bay 		HOM E18.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E18.5		 BCM
IMPC		 0.00
Smg5
Smg5em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Snai2
Snai2tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Snx3
Snx3tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 JAX
IMPC		 0.00
Tbr1
Tbr1tm1.1(KOMP)Mbp 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Tbr1
Tbr1tm1.1(KOMP)Mbp 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Tctn1
Tctn1em1(IMPC)Mbp 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Tctn1
Tctn1em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Tmem132a
Tmem132atm1b(KOMP)Wtsi 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 BCM
IMPC		 0.00
Tmem132a
Tmem132atm1b(KOMP)Wtsi 		HOM E18.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E18.5		 BCM
IMPC		 0.00
Ubr2
Ubr2tm1e.1(KOMP)Mbp 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Ubr2
Ubr2tm1e.1(KOMP)Mbp 		HOM E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Ufsp2
Ufsp2em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Xpo1
Xpo1em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Xpo5
Xpo5em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Zc3h11a
Zc3h11aem1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Zc3h4
Zc3h4em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 spina bifida spina bifida
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00

Download data as:   TSV   XLS

 The way we measure

Procedure
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
Gross Morphology Embryo E18.5

 Phenotype associations stats

4.54% of tested genes with null mutations on a B6N genetic background have a phenotype association to spina bifida (30/661)

13.93% females (28/201) 14.43% males (29/201)

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter