banner
Genes Phenotypes Help, News, Blog

Phenotype: microcephaly

Definition
an abnormally small head
Synonyms
reduced head size,  decreased head size,  small head
Significant gene associations The way we measure Phenotype stats
0%
of tested genes
0
significant genes
0
tested genes

IMPC Gene variants with microcephaly

Total number of significant genotype-phenotype associations: 111

Gene / Allele Zygosity Sex Life Stage Phenotype Parameter Phenotyping
Center		 P Value
Actg1
Actg1tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Actg1
Actg1tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Apbb2
Apbb2tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Apbb2
Apbb2tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Cep97
Cep97tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Cep97
Cep97tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Cnnm2
Cnnm2tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Cnnm2
Cnnm2tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Cwc22
Cwc22em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Dbn1
Dbn1tm1b(KOMP)Wtsi 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Dbn1
Dbn1tm1b(KOMP)Wtsi 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Dlg5
Dlg5tm1b(EUCOMM)Wtsi 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Dlg5
Dlg5tm1b(EUCOMM)Wtsi 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Dnm1
Dnm1tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Dnm1
Dnm1tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Gabpa
Gabpaem2(IMPC)Mbp 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Gabpa
Gabpaem2(IMPC)Mbp 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Gjb3
Gjb3tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Gjb3
Gjb3tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Krt14
Krt14tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Krt14
Krt14tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Lgi4
Lgi4tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Lgi4
Lgi4tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Mbd6
Mbd6tm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Mbd6
Mbd6tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Myb
Mybtm1b(KOMP)Wtsi 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Myb
Mybtm1b(KOMP)Wtsi 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Nalcn
Nalcnem1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Nalcn
Nalcnem1(IMPC)Mbp 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Nxn
Nxntm1b(EUCOMM)Wtsi 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Nxn
Nxntm1b(EUCOMM)Wtsi 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Pccb
Pccbtm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Pccb
Pccbtm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Rbbp4
Rbbp4em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Rbm22
Rbm22em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Rnf10
Rnf10tm1b(KOMP)Wtsi 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Rnf10
Rnf10tm1b(KOMP)Wtsi 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Scx
Scxtm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Scx
Scxtm1.1(KOMP)Vlcg 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Smg5
Smg5em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Snai2
Snai2tm1.1(KOMP)Vlcg 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Sptan1
Sptan1em1(IMPC)Mbp 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Tbr1
Tbr1tm1.1(KOMP)Mbp 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Tbr1
Tbr1tm1.1(KOMP)Mbp 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Tctn1
Tctn1em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Tctn1
Tctn1em1(IMPC)Mbp 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Ubr2
Ubr2tm1e.1(KOMP)Mbp 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Ubr2
Ubr2tm1e.1(KOMP)Mbp 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Ufsp2
Ufsp2em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Xpo1
Xpo1em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Xpo5
Xpo5em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Zc3h11a
Zc3h11aem1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Zc3h4
Zc3h4em1(IMPC)Mbp 		HET E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00
Zfp414
Zfp414em1(IMPC)Bay 		HOM E18.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E18.5		 BCM
IMPC		 0.00
Zfp503
Zfp503em1(IMPC)Mbp 		HOM E15.5 microcephaly Microcephaly
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5		 UC Davis
IMPC		 0.00

Download data as:   TSV   XLS

 The way we measure

Procedure
Combined SHIRPA and Dysmorphology
Gross Morphology Embryo E12.5
Gross Morphology Embryo E14.5-E15.5
Gross Morphology Embryo E18.5
Brain Histopathology

 Phenotype associations stats

0.74% of tested genes with null mutations on a B6N genetic background have a phenotype association to microcephaly (34/4570)

0.74% females (33/4473) 0.76% males (34/4466)

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter